公司职员纳税通常遵循以下步骤：
预扣预缴
公司在支付员工工资时，根据国家规定的税率预扣个人所得税。
税率根据员工每月工资薪金所得的不同而划分。
确定年度应纳税所得额
员工将全年工资薪金所得、奖金、津贴、补贴等汇总。
减去起征点（目前为每月5000元）和其他扣除项（如社会保险、公积金等），计算出年度应纳税所得额。
汇算清缴
在年度结束后，员工需向税务机关报送个人所得税自行申报表，并根据实际所得额和预扣预缴情况进行汇算清缴。
若预扣预缴税额不足，需补缴税款；若预扣预缴税额过多，可申请退税。
享受税收优惠
员工可能享受如子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息等专项附加扣除，减少应纳税所得额。
公司代扣代缴
公司负责代扣代缴员工个人所得税，并在发放工资时代扣。
公司需在次月十五日前向税务机关报送纳税申报表并缴纳税款。
个人所得税计算公式
应纳税所得额 = 税前工资收入金额 - 五险一金（个人缴纳部分） - 费用减除额。
应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数。
其他注意事项
员工实发工资超过5000元需缴纳个人所得税，5000元及以下不用交税。
公司为员工代扣并完税后，个人不需要再缴纳税款。
公司代扣代缴的税款进入国家财政，并按照地方和国库分成管理。
以上步骤和规定根据最新的税法和相关政策可能会有所变动，请以最新的法律法规为准。