原木发票的抵扣流程通常包括以下几个步骤：
1. 确保原木发票符合增值税专用发票的要求。
2. 将发票信息录入增值税发票管理系统。
3. 在企业财务系统中进行认证，认证通过后，系统会自动生成进项税额。
4. 在申报增值税时，将进项税额申报抵扣。
请注意，原木发票需在认证当月申报抵扣，超过期限将无法抵扣。
此外，如果从农户手中购买农户自产的原木，并给农户开具农产品收购发票，或者取得农户通过税务局代开的免税的增值税普通发票，可以按照规定的扣除率（如9%或10%）计算抵扣进项税额。
请根据您的具体情况，按照上述步骤操作，并确保所有步骤符合当地税务机关的规定和要求。